![]() |
PlantRegMap/PlantTFDB v5.0
Plant Transcription
Factor Database
|
| Home TFext BLAST Prediction Download Help About Links PlantRegMap |
Phylogenetic Tree for
Setaria italica
B3 Family| Phylogenetic tree for domain ? help Back to Top |
|---|
Subtree rooted at node 149:
/--------------- Seita.5G005600.1.p/134-222 (2)
|
/-----------100-----------+ /---------- Seita.9G515300.1.p/137-227 (10)
| | |
| \-66-+ /----- Seita.6G024700.1.p/139-229 (51)
| | |
| \-93-+----- Seita.9G356700.1.p/113-204 (66)
| |
| \----- Seita.3G202300.1.p/223-310 (75)
|
| /--------------------- Seita.6G064600.1.p/101-187 (5)
| |
| |--------------------- Seita.9G342100.1.p/30-133 (24)
| |
| | /---------- Seita.1G273900.1.p/105-205 (26)
| | |
| | /-71-+ /----- Seita.8G036800.1.p/34-133 (32)
| | | \-100+
| /-100+ | \----- Seita.7G298100.1.p/37-133 (63)
| | |--57-+
| | | | /----- Seita.7G211000.1.p/100-200 (43)
| | | \----97---+
| | | \----- Seita.9G562700.1.p/31-135 (87)
| | |
| | | /----- Seita.6G055600.1.p/57-143 (46)
| | \-------99------+
| /-50-+ \----- Seita.4G005900.1.p/32-132 (69)
| | |
| | | /----- Seita.2G432900.1.p/364-463 (8)
| | | /------100------+
| | | | \----- Seita.2G353300.1.p/459-558 (31)
| | | |
| | | | /----- Seita.6G001300.1.p/229-314 (22)
| /-100+ \-97-+ /-100+
| | | | | \----- Seita.3G016300.1.p/300-395 (82)
| | | | /-63-+
| | | | | \---------- Seita.5G293900.1.p/191-286 (48)
| | | \-100-+
|-58-+ | \--------------- Seita.5G423900.1.p/533-629 (73)
| | |
| | \------------------------------- Seita.5G243800.1.p/79-177 (36)
| |
| | /----- Seita.5G419700.1.p/591-657 (18)
| \--------------100-------------+
| \----- Seita.1G220700.1.p/843-924 (29)
|
| /----- Seita.7G055100.1.p/196-277 (7)
| /----56---+
| | \----- Seita.7G053800.1.p/200-252 (70)
| |
| | /----- Seita.7G054700.1.p/307-387 (21)
| |---100---+
| | \----- Seita.7G054900.1.p/311-394 (52)
| |
| | /---------- Seita.7G054200.1.p/307-382 (42)
| | |
| |-52-+ /----- Seita.7G054500.1.p/30-104 (53)
| /--89-+ \-100+
| | | \----- Seita.7G054800.1.p/28-111 (56)
/-100+ | |
| | | | /----- Seita.7G054100.1.p/257-329 (45)
| | | | /-100+
| | | | | \----- Seita.7G053800.1.p/261-334 (54)
| | /-100+ |-98-+
| | | | | \---------- Seita.7G055000.1.p/240-323 (68)
| | | | |
| | | | \--------------- Seita.4G208800.1.p/249-330 (61)
| |------75------+ |
| | | \--------------------- Seita.7G054300.1.p/46-110 (47)
| | |
| | \-------------------------- Seita.9G493500.1.p/176-250 (16)
| |
| | /--------------- Seita.3G372700.1.p/269-356 (14)
| | |
| | /--93-+ /---------- Seita.3G372300.1.p/246-344 (17)
| | | | |
| | | \-100+ /----- Seita.3G372600.1.p/256-354 (27)
| | /-95-+ \-53-+
| | | | \----- Seita.3G372500.1.p/255-343 (64)
| | | |
| | | \--------------------- Seita.9G166000.1.p/276-375 (76)
| | /-59-+
| | | | /--------------- Seita.9G166700.1.p/251-345 (20)
| | | | |
| | | | | /----- Seita.9G167200.1.p/263-346 (25)
| | | \----100---+ /-73-+
| |----64---+ | | \----- Seita.9G167000.1.p/266-346 (34)
| | | \-97-+
| | | \---------- Seita.9G167100.1.p/248-347 (58)
| | |
| | \------------------------------- Seita.3G372100.1.p/40-114 (79)
| |
| | /----- Seita.9G167200.1.p/437-529 (15)
| | /-74-+
| | | \----- Seita.9G166900.1.p/14-93 (44)
| | |
| | /-54-+---------- Seita.9G167100.1.p/487-577 (71)
| | | |
| | /--66-+ \---------- Seita.9G166700.1.p/460-538 (74)
| | | |
| | /-69-+ \--------------- Seita.9G167000.1.p/471-539 (40)
| | | |
| | | \--------------------- Seita.9G166800.1.p/469-537 (78)
| | |
/--93-+ |------57------+-------------------------- Seita.9G166600.1.p/257-334 (65)
| | | |
| | | |-------------------------- Seita.3G372200.1.p/231-323 (67)
| | | |
| | | \-------------------------- Seita.9G166500.1.p/264-332 (84)
| | |
| | | /----- Seita.4G008200.1.p/67-145 (19)
| | |----------------100----------------+
| | | \----- Seita.7G073500.1.p/67-147 (81)
| | |
| | |----------------------------------------- Seita.8G067000.1.p/369-460 (33)
| | |
| | \----------------------------------------- Seita.5G301900.1.p/306-392 (35)
| |
| | /----- Seita.7G054400.1.p/141-222 (6)
| | /-100+
| | | \----- Seita.7G053800.1.p/75-165 (39)
| | /-100+
| | | | /----- Seita.7G054700.1.p/150-229 (28)
| | | \-99-+
| | /--99-+ \----- Seita.7G054900.1.p/150-229 (83)
| | | |
| | | \--------------- Seita.4G208800.1.p/72-156 (30)
| | |
| |-----------92-----------+ /----- Seita.7G054400.1.p/23-101 (41)
| | | /-92-+
| | | | \----- Seita.7G054200.1.p/22-105 (55)
| | \----100---+
/-100+ | | /----- Seita.7G054900.1.p/52-112 (62)
| | | \-98-+
| | | \----- Seita.7G054700.1.p/52-112 (80)
| | |
| | | /----- Seita.9G374600.1.p/21-95 (12)
| | | /-86-+
| | | | \----- Seita.8G067000.1.p/107-195 (49)
| | |-----------------79----------------+
| | | | /----- Seita.5G419700.1.p/86-173 (13)
| | | \-100+
| | | \----- Seita.1G220700.1.p/295-376 (50)
| | |
| | |---------------------------------------------- Seita.5G302100.1.p/18-107 (37)
| | |
| | |---------------------------------------------- Seita.5G301900.1.p/19-117 (72)
| | |
/-100+ | \---------------------------------------------- Seita.9G493500.1.p/39-133 (77)
| | |
| | | /----- Seita.9G166700.1.p/40-120 (4)
| | | /-67-+
| | | | \----- Seita.9G167200.1.p/40-120 (11)
| | | /-97-+
| | | | \---------- Seita.9G167000.1.p/36-121 (60)
| | | /-100-+
| | | | \--------------- Seita.9G167100.1.p/39-121 (57)
--69-+ | | |
| | | | /----- Seita.9G166400.1.p/27-115 (9)
| | \--------------89--------------+-------98------+
| | | \----- Seita.9G166500.1.p/36-118 (38)
| | |
| | \--------------------- Seita.3G372200.1.p/26-115 (86)
| |
| \--------------------------------------------------------- Seita.9G166000.1.p/51-131 (23)
|
\-------------------------------------------------------------- Seita.3G372300.1.p/29-116 (3)
Root part of tree:
/------------------------------------------------------------------- Seita.3G372600.1.p/38-126 (1)
|
|------------------------------------------------------------------- Seita.3G372700.1.p/39-127 (59)
+
| /--------------------------------- (149)
\----------------72---------------+
\--------------------------------- Seita.3G372500.1.p/31-119 (85)
|
| Phylogenetic tree for protein ? help Back to Top |
|---|
Subtree rooted at node 101:
/----- Seita.9G166400.1.p (2)
/-----------100-----------+
| \----- Seita.9G166500.1.p (19)
|
| /--------------------- Seita.9G167100.1.p (5)
| |
| | /---------- Seita.9G167000.1.p (14)
| /-90-+ |
| | | /-68-+ /----- Seita.9G166800.1.p (33)
| | | | \-100+
/-59-+ | \--98-+ \----- Seita.9G166900.1.p (39)
| |-100+ |
| | | \--------------- Seita.9G167200.1.p (25)
| | |
| | \-------------------------- Seita.9G166700.1.p (31)
/-76-+ |
| | |------------------------------- Seita.3G372200.1.p (10)
| | |
| | \------------------------------- Seita.9G166600.1.p (46)
| |
| \------------------------------------ Seita.3G372100.1.p (58)
|
/-73-+ /---------- Seita.3G372300.1.p (20)
| | |
| | /-55-+ /----- Seita.3G372500.1.p (29)
| | | \-61-+
| | /-100-+ \----- Seita.3G372600.1.p (48)
| | | |
| \---------99--------+ \--------------- Seita.3G372700.1.p (32)
| |
| \--------------------- Seita.9G166000.1.p (27)
|
| /----- Seita.4G008200.1.p (3)
| /--------------100-------------+
| | \----- Seita.7G073500.1.p (57)
| |
| | /----- Seita.4G005900.1.p (4)
| | /---------82---------+
| | | \----- Seita.6G055600.1.p (43)
| | |
| | | /----- Seita.1G273900.1.p (9)
| | | /-86-+
| | | | \----- Seita.7G211000.1.p (16)
| | | /-74-+
| | | | \---------- Seita.5G243800.1.p (35)
| | |----100---+
| | | | /----- Seita.9G342100.1.p (17)
|----74---+ | \----91---+
| | | \----- Seita.9G562700.1.p (42)
| | |
| | | /----- Seita.8G036800.1.p (18)
| | |---------100--------+
| | /-100+ \----- Seita.7G298100.1.p (51)
| | | |
| | | | /--------------- Seita.5G293900.1.p (22)
/-100-+ | | | |
| | | | | | /----- Seita.3G016300.1.p (37)
| | | | | /-100-+ /-100+
| | | | | | | | \----- Seita.6G001300.1.p (55)
| | | | | | \-58-+
| | | | |-100+ \---------- Seita.5G423900.1.p (50)
| | \-70-+ | |
| | | | | /----- Seita.2G353300.1.p (34)
| | | | \------100------+
| | | | \----- Seita.2G432900.1.p (52)
| | | |
| | | \-------------------------- Seita.6G064600.1.p (26)
| | |
| | | /----- Seita.1G220700.1.p (12)
| | \------------70-----------+
| | \----- Seita.5G419700.1.p (49)
| |
| |---------------------------------------------- Seita.9G493500.1.p (11)
| |
| | /---------- Seita.5G301900.1.p (13)
/-61-+ | |
| | | /-84-+ /----- Seita.9G374600.1.p (23)
| | | | \-86-+
| | |--------------53--------------+ \----- Seita.8G067000.1.p (40)
| | | |
| | | \--------------- Seita.5G302100.1.p (15)
| | |
| | | /--------------- Seita.5G005600.1.p (30)
| | | |
| | | /--66-+ /---------- Seita.9G515300.1.p (38)
| | | | | |
| | | | \-89-+ /----- Seita.9G356700.1.p (45)
/-53-+ | \-----------100----------+ \-99-+
| | | | \----- Seita.6G024700.1.p (54)
| | | |
| | | \--------------------- Seita.3G202300.1.p (44)
| | |
| | | /----- Seita.7G054900.1.p (8)
| | | /-100+
| | | | \----- Seita.7G054700.1.p (28)
--60-+ | \--------------------63-------------------+
| | \---------- Seita.4G208800.1.p (47)
| |
| | /----- Seita.7G054100.1.p (21)
| \------------------------100------------------------+
| \----- Seita.7G053800.1.p (53)
|
\-------------------------------------------------------------- Seita.7G054300.1.p (36)
Root part of tree:
/------------------------------------------------------------------- Seita.7G054200.1.p (1)
|
| /----------------- Seita.7G054800.1.p (41)
|-----------------------100-----------------------+
+ \----------------- Seita.7G054500.1.p (56)
|
| /-------------------------------------------------- (101)
| |
\-------55-------+ /--------------------------------- Seita.7G054400.1.p (6)
| |
\-------80-------+ /----------------- Seita.7G055100.1.p (7)
\-------53------+
\----------------- Seita.7G055000.1.p (24)
|




