![]() |
PlantRegMap/PlantTFDB v5.0
Plant Transcription
Factor Database
|
| Home TFext BLAST Prediction Download Help About Links PlantRegMap |
Phylogenetic Tree for
Setaria viridis
B3 Family| Phylogenetic tree for domain ? help Back to Top |
|---|
/------------------------------------------------------------------- Sevir.9G164600.1.p/460-538 (1)
|
| /------ Sevir.7G060700.1.p/113-196 (2)
| /----100---+
| | \------ Sevir.7G061100.1.p/3-81 (93)
| |
| /-97-+ /----------- Sevir.7G060500.1.p/114-197 (25)
| | | |
| | \--57-+ /------ Sevir.7G060300.1.p/75-162 (33)
| | \-100+
| /----------100---------+ \------ Sevir.7G059800.1.p/88-175 (78)
| | |
| | | /------ Sevir.7G061300.1.p/150-229 (7)
| | \------100------+
| | \------ Sevir.7G060800.1.p/150-229 (23)
| |
| | /------ Sevir.7G061300.1.p/51-112 (5)
| | /----------98---------+
| | | \------ Sevir.7G060800.1.p/52-112 (80)
| | |
| | /-99-+ /---------------------- Sevir.7G059800.1.p/1-78 (21)
| | | | |
| | | | | /----------- Sevir.7G061200.1.p/25-105 (28)
| | | \--97-+ |
| | | | /--95-+ /------ Sevir.7G060400.1.p/22-105 (86)
| | /-100-+ | | \-100+
| | | | \-69-+ \------ Sevir.7G060200.1.p/23-103 (88)
| | | | |
| | | | \----------------- Sevir.7G060500.1.p/1-74 (83)
| |--63-+ |
| | | \--------------------------------- Sevir.4G218000.1.p/2-80 (68)
| | |
| | \--------------------------------------- Sevir.9G497500.1.p/39-133 (51)
| |
| | /------ Sevir.3G389500.1.p/29-116 (6)
| | /----100---+
| | | \------ Sevir.3G389400.1.p/29-116 (43)
| | |
| | /-100+ /----------- Sevir.3G389700.1.p/30-119 (11)
| | | | |
| | | \--86-+ /------ Sevir.3G389900.1.p/39-127 (52)
| /-100+ /----100---+ \-84-+
| | | | | \------ Sevir.3G389800.1.p/38-126 (59)
| | | | |
| | | | \---------------------- Sevir.9G164000.1.p/51-131 (50)
| | | |
| | | | /------ Sevir.9G164600.1.p/40-121 (14)
| | | | /-64-+
| | | | | \------ Sevir.9G165200.1.p/40-120 (64)
| | |----100----+ /--96-+
| | | | | \----------- Sevir.9G164900.1.p/41-126 (61)
| | | | /-100+
| | | | | \----------------- Sevir.9G165100.1.p/39-121 (74)
| | | | /--80-+
| | | | | | /------ Sevir.9G164400.1.p/36-118 (19)
| | | | | \------100------+
| | | | | \------ Sevir.9G164300.1.p/27-115 (26)
| | | \-59-+
| | | | /------ Sevir.3G389300.1.p/3-79 (45)
| | | | |
| | | \---------100---------+------ Sevir.3G389200.1.p/27-95 (66)
| | | |
| | | \------ Sevir.3G388900.1.p/26-115 (69)
| | |
| | |--------------------------------------------- Sevir.5G304700.1.p/18-107 (8)
| | |
| | | /------ Sevir.5G425100.1.p/86-173 (47)
| | |------------------100-----------------+
| | | \------ Sevir.1G224600.1.p/315-396 (75)
| | |
| | |--------------------------------------------- Sevir.8G068300.1.p/107-195 (70)
| | |
| | \--------------------------------------------- Sevir.5G304500.1.p/19-117 (77)
| |
| | /------ Sevir.3G207300.1.p/229-316 (4)
| | |
| | /-97-+------ Sevir.6G023400.1.p/139-229 (37)
| | | |
| | /--68-+ \------ Sevir.9G362600.1.p/113-204 (71)
| | | |
| |---------------100--------------+ \----------- Sevir.9G519800.1.p/137-227 (73)
| | |
| | \----------------- Sevir.5G005700.1.p/134-222 (49)
| |
| | /----------- Sevir.5G296800.1.p/191-286 (9)
| | |
| | /--59-+ /------ Sevir.3G017300.1.p/295-390 (35)
| | | \-100+
| | /-100+ \------ Sevir.6G001200.1.p/259-344 (84)
| | | |
| | | \----------------- Sevir.5G429500.1.p/533-629 (63)
| | /-------99-------+
+ | | | /------ Sevir.2G364100.1.p/459-558 (10)
| | | \------100------+
| | | \------ Sevir.2G445900.1.p/364-463 (89)
| | |
| | | /------ Sevir.8G036200.1.p/34-133 (16)
| | | /----100---+
| | | | \------ Sevir.7G309900.1.p/37-133 (67)
| | | |
| | | | /----------- Sevir.6G053000.1.p/57-143 (18)
| | | | |
| |----100---+ /-60-+--96-+ /------ Sevir.4G005900.1.p/32-134 (55)
| | | | | \-58-+
| | | | | \------ Sevir.7G277400.1.p/117-182 (91)
| | | | |
| /--61-+ | /--66-+ \----------------- Sevir.1G279100.1.p/105-205 (27)
| | | | | |
| | | | | | /------ Sevir.9G566400.1.p/31-135 (20)
| | | | /-96-+ \-------91------+
| | | | | | \------ Sevir.7G222800.1.p/100-200 (44)
| | | | | |
| | | \--83-+ \---------------------------- Sevir.9G346500.1.p/30-133 (40)
| | | |
| | | \--------------------------------- Sevir.5G251900.1.p/79-177 (46)
| | |
| | |-------------------------------------------------- Sevir.8G068300.1.p/369-460 (12)
| | |
| | | /---------------------------- Sevir.9G164000.1.p/276-375 (15)
| | | |
| | | | /------ Sevir.3G389500.1.p/246-344 (31)
| | | | /-100+
| | | | | \------ Sevir.3G389400.1.p/246-344 (65)
| | | /-97-+ /--57-+
| | | | | | \----------- Sevir.3G389800.1.p/256-354 (72)
| | | | | /-99-+
| | | | | | \----------------- Sevir.3G389700.1.p/255-343 (79)
| | | | \--80-+
| | | | \---------------------- Sevir.3G389900.1.p/267-355 (82)
| | | |
| | |-------86-------+ /----------- Sevir.9G164800.1.p/186-252 (30)
| | | | |
| | | | | /------ Sevir.9G165200.1.p/263-346 (34)
| | | | /--92-+-59-+
| | | | | | \------ Sevir.9G164900.1.p/271-351 (87)
| | | | | |
| | | \------100------+ \----------- Sevir.9G165100.1.p/248-344 (54)
| | | |
| | | \----------------- Sevir.9G164600.1.p/251-347 (48)
| | |
| | | /----------- Sevir.7G060400.1.p/300-375 (17)
| /-99-+ | |
| | | | /--85-+ /------ Sevir.7G061000.1.p/22-105 (60)
| | | | | \-100+
| | | | | \------ Sevir.7G060700.1.p/267-350 (85)
| | | | /-59-+
| | | | | | /------ Sevir.7G061400.1.p/275-358 (36)
| | | | | \----100---+
| | | | /--99-+ \------ Sevir.7G059800.1.p/292-365 (39)
| | | | | |
| | | | | | /------ Sevir.7G059800.1.p/214-283 (38)
| | | | /-54-+ \-------74------+
| | | | | | \------ Sevir.7G060800.1.p/307-387 (42)
| | | | | |
| | | | /-100-+ \---------------------------- Sevir.7G060500.1.p/278-361 (32)
| | | | | |
| | | |----67----+ \--------------------------------- Sevir.4G218000.1.p/262-339 (81)
| | | | |
| | | | \--------------------------------------- Sevir.9G497500.1.p/176-250 (90)
| | | |
|--95-+ | | /------ Sevir.1G224600.1.p/873-948 (22)
| | | |--------------------100--------------------+
| | | | \------ Sevir.5G425100.1.p/592-658 (41)
| | | |
| | | | /------ Sevir.4G008000.1.p/67-145 (29)
| | | |--------------------100--------------------+
| | | | \------ Sevir.7G079600.1.p/67-147 (56)
| | | |
| | | |-------------------------------------------------- Sevir.3G389300.1.p/177-235 (57)
| | | |
| | | \-------------------------------------------------- Sevir.5G304500.1.p/306-392 (62)
| | |
| | | /------ Sevir.3G388900.1.p/239-323 (13)
| | | /-73-+
| | | | \------ Sevir.3G389300.1.p/309-394 (53)
| | \---------------------63---------------------+
| | \----------- Sevir.9G164400.1.p/264-332 (92)
| |
| \------------------------------------------------------------- Sevir.9G164700.1.p/469-537 (3)
|
| /------ Sevir.9G165200.1.p/437-529 (24)
| /-93-+
| | \------ Sevir.9G165100.1.p/487-577 (76)
\---------------------------59--------------------------+
\----------- Sevir.9G164900.1.p/476-544 (58)
|
| Phylogenetic tree for protein ? help Back to Top |
|---|
Subtree rooted at node 103:
/---------- Sevir.3G207300.1.p (2)
|
/-99-+ /----- Sevir.6G023400.1.p (5)
| \-99-+
/--93-+ \----- Sevir.9G362600.1.p (33)
| |
/-99-+ \--------------- Sevir.5G005700.1.p (21)
| |
| \--------------------- Sevir.9G519800.1.p (7)
/---------66--------+
| | /----- Sevir.4G008000.1.p (10)
| \---------100--------+
| \----- Sevir.7G079600.1.p (42)
|
| /----- Sevir.7G060500.1.p (8)
| /-------95------+
| | \----- Sevir.7G061400.1.p (34)
| |
| | /----- Sevir.7G060700.1.p (13)
| | /-99-+
| /-77-+ | \----- Sevir.7G061000.1.p (39)
| | | /-95-+
| | | | | /----- Sevir.7G061200.1.p (31)
| | | | \-58-+
| | \--93-+ \----- Sevir.7G061100.1.p (49)
| | |
/--53-+ /-86-+ \--------------- Sevir.7G060400.1.p (52)
| | | |
| | | |-------------------------- Sevir.7G060200.1.p (14)
| | | |
| | | | /----- Sevir.7G060300.1.p (26)
| | /-86-+ \---------88---------+
| | | | \----- Sevir.7G059800.1.p (57)
| | | |
| | | | /----- Sevir.7G061300.1.p (35)
| | /-100+ \-----------100-----------+
| | | | \----- Sevir.7G060800.1.p (50)
| | | |
| |-91-+ \------------------------------------ Sevir.4G218000.1.p (29)
| | |
| | \----------------------------------------- Sevir.9G497500.1.p (59)
| |
| | /----- Sevir.5G304500.1.p (16)
| \-------------------95-------------------+
| \----- Sevir.8G068300.1.p (36)
|
| /----- Sevir.3G389700.1.p (3)
| /-90-+
| | \----- Sevir.3G389800.1.p (17)
| /-80-+
| | \---------- Sevir.3G389900.1.p (58)
| /-100-+
| | | /----- Sevir.3G389400.1.p (48)
/-97-+ | \---100---+
| | /------100-----+ \----- Sevir.3G389500.1.p (51)
| | | |
| | | \--------------------- Sevir.9G164000.1.p (20)
| | |
| | | /----- Sevir.3G389200.1.p (4)
| | | /-68-+
| | | | \----- Sevir.3G389300.1.p (37)
| | | /-------97------+
| | | | \---------- Sevir.3G388900.1.p (40)
| |-------95------+ |
| | | | /----- Sevir.9G164800.1.p (11)
| | | /-79-+ /------100------+
| | | | | | \----- Sevir.9G164700.1.p (41)
| | | | | |
/-99-+ | | | | | /----- Sevir.9G165100.1.p (19)
| | | | | \-100+ /-73-+
| | | | | | | \----- Sevir.9G164600.1.p (27)
| | | \-94-+ | /-51-+
| | | | | | \---------- Sevir.9G165200.1.p (30)
| | | | \--54-+
| | | | \--------------- Sevir.9G164900.1.p (43)
| | | |
| | | | /----- Sevir.9G164300.1.p (28)
| | | \-----------100-----------+
| | | \----- Sevir.9G164400.1.p (46)
| | |
| | \---------------------------------------------------- Sevir.5G304700.1.p (9)
| |
| | /----- Sevir.5G425100.1.p (22)
| \-------------------------54------------------------+
--78-+ \----- Sevir.1G224600.1.p (32)
|
| /---------- Sevir.5G296800.1.p (6)
| |
| |---------- Sevir.5G429500.1.p (15)
| /-99-+
| | | /----- Sevir.3G017300.1.p (53)
| | \-100+
|----------------------99----------------------+ \----- Sevir.6G001200.1.p (56)
| |
| | /----- Sevir.2G445900.1.p (12)
| \---100---+
| \----- Sevir.2G364100.1.p (44)
|
| /----- Sevir.7G309900.1.p (24)
\---------------------------100--------------------------+
\----- Sevir.8G036200.1.p (45)
Root part of tree:
/------------------------------------------------------------------- Sevir.4G005900.1.p (1)
|
|------------------------------------------------------------------- Sevir.7G277400.1.p (54)
|
| /---------------------------------------- (103)
| |
| | /------------- Sevir.9G566400.1.p (18)
+ | /------73-----+
| | | \------------- Sevir.9G346500.1.p (55)
| /------85-----+-----100----+
| | | | /------------- Sevir.1G279100.1.p (23)
| | | \-----100-----+
| | | \------------- Sevir.7G222800.1.p (38)
\-----100----+ |
| \---------------------------------------- Sevir.5G251900.1.p (25)
|
\------------------------------------------------------ Sevir.6G053000.1.p (47)
|




