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Phylogenetic Tree for
Panicum virgatum
M-type_MADS Family| Phylogenetic tree for domain ? help Back to Top |
|---|
/------------------------------------------------------------------- Pavir.5KG297000.1.p/86-115 (1)
|
|------------------------------------------------------------------- Pavir.6NG327900.1.p/39-88 (3)
|
|------------------------------------------------------------------- Pavir.6KG380000.1.p/39-88 (54)
|
|------------------------------------------------------------------- Pavir.J642900.1.p/39-88 (55)
|
| /------- Pavir.6KG278500.1.p/18-65 (2)
| |
| /-----99-----+------- Pavir.6NG180900.1.p/18-44 (20)
| | |
| | \------- Pavir.5NG401400.1.p/18-65 (51)
| |
| /--85--+ /------- Pavir.2NG122200.1.p/16-62 (18)
| | | /--99-+
| | | | \------- Pavir.2KG161800.1.p/16-62 (26)
| | \--92--+
| /---------94--------+ \------------- Pavir.2KG161700.1.p/16-62 (44)
| | |
| | | /------- Pavir.6KG163800.1.p/31-75 (9)
| | \--------100--------+
| | \------- Pavir.4KG054200.1.p/31-75 (45)
| |
| | /------- Pavir.5KG722400.1.p/22-53 (4)
| | /-100-+
| | | \------- Pavir.J504400.1.p/22-53 (12)
| | |
| | |------------- Pavir.5KG723900.1.p/14-52 (8)
| | |
| | /--78--+------------- Pavir.5KG345600.1.p/12-48 (13)
| | | |
| | | |------------- Pavir.5KG716100.1.p/11-52 (24)
| | | |
| | | | /------- Pavir.2KG224700.1.p/4-45 (57)
| | | \--84-+
| | /-----97-----+ \------- Pavir.7KG126500.1.p/21-62 (58)
| | | |
| | | | /------- Pavir.5NG350100.1.p/11-49 (5)
| | | | |
| | | | |------- Pavir.2NG219900.1.p/11-52 (17)
| | | \-----99-----+
| | | |------- Pavir.9KG525300.1.p/205-233 (48)
| | | |
| | | \------- Pavir.5KG231400.1.p/11-52 (62)
| | |
| | /--97--+ /------- Pavir.5KG078600.1.p/1-25 (10)
| | | | |
| | | | /-----97-----+------- Pavir.8KG311400.1.p/48-85 (25)
| | | | | |
| | | | | \------- Pavir.5NG080200.1.p/10-52 (41)
| | | | |
| | | | /--51--+ /------- Pavir.1NG284500.1.p/11-52 (47)
| | | | | | /--99-+
| /--97--+ | | | | | \------- Pavir.1KG322300.1.p/10-53 (60)
| | | | | | \--76--+
| | |--72--+ \--89-+ \------------- Pavir.9NG223700.1.p/11-50 (52)
| | | | |
| | | | | /------- Pavir.5NG294400.1.p/9-48 (31)
+ | | | \--------100--------+
| | | | \------- Pavir.5KG183900.1.p/11-49 (40)
| | | |
| | | | /------- Pavir.J272800.1.p/12-50 (16)
| | | | /-100-+
| | | | | \------- Pavir.3KG138300.1.p/12-51 (38)
| | | \------------84------------+
| | | \------------- Pavir.4KG233600.1.p/11-56 (19)
| | |
| | | /------- Pavir.4KG209500.1.p/20-64 (6)
| | | |
| | | |------- Pavir.4NG204500.1.p/20-63 (28)
| | | /-----100----+
| | | | |------- Pavir.4NG227300.1.p/22-63 (35)
| | | | |
| /--99-+ | | \------- Pavir.4NG204700.1.p/34-65 (49)
| | | | |
| | | | | /------- Pavir.3KG244300.1.p/24-66 (22)
| | | |------------99------------+-----99-----+
| | | | | \------- Pavir.3NG153600.1.p/24-66 (46)
| | | | |
| | | | | /------------- Pavir.4KG241600.1.p/15-58 (27)
| | | | | |
| | | | \--100-+ /------- Pavir.8NG209600.1.p/16-56 (29)
| | | | \--80-+
| | | | \------- Pavir.4NG163500.1.p/16-56 (34)
| | | |
| | | | /------- Pavir.2NG032000.1.p/12-58 (21)
| | | | /-100-+
| | | | | \------- Pavir.2KG045600.1.p/12-58 (50)
| | | \---------------100---------------+
|--100-+ | | /------- Pavir.5NG313900.1.p/12-59 (23)
| | | \-100-+
| | | \------- Pavir.5KG407600.1.p/12-59 (42)
| | |
| | \------------------------------------------------------ Pavir.4KG106900.1.p/9-59 (14)
| |
| | /------- Pavir.8KG359700.1.p/10-53 (7)
| | /-100-+
| | | \------- Pavir.8KG374900.1.p/10-53 (30)
| | |
| | /--100-+ /------- Pavir.6KG335800.1.p/10-58 (11)
| | | | |
| | | \--52-+------- Pavir.J460500.1.p/10-58 (43)
| | | |
| | | \------- Pavir.6KG337700.1.p/10-58 (59)
| \-------------------97------------------+
| | /------- Pavir.5KG177900.1.p/9-59 (15)
| | /--59-+
| | | \------- Pavir.5KG175400.1.p/9-59 (36)
| \--97--+
| \------------- Pavir.3NG044100.1.p/72-110 (32)
|
| /------- Pavir.9KG306400.1.p/44-88 (33)
| /--56-+
| | \------- Pavir.5KG736600.1.p/11-60 (53)
| |
| | /------- Pavir.5NG119700.1.p/11-50 (37)
| |--99-+
\--------------------------90-------------------------+ \------- Pavir.5NG096100.1.p/42-74 (39)
|
|------------- Pavir.7NG207900.1.p/82-106 (56)
|
\------------- Pavir.8KG132000.1.p/3-50 (61)
|
| Phylogenetic tree for protein ? help Back to Top |
|---|
Subtree rooted at node 97:
/----- Pavir.6KG278500.1.p (2)
|
/----------------100----------------+----- Pavir.5NG401400.1.p (16)
| |
| \----- Pavir.6NG180900.1.p (35)
|
| /----- Pavir.8KG374900.1.p (3)
| /--------------100-------------+
| | \----- Pavir.8KG359700.1.p (32)
| |
| | /---------- Pavir.5KG736600.1.p (5)
| | |
/-64-+ | /-69-+ /----- Pavir.8KG132000.1.p (55)
| | | | \-96-+
| | | | \----- Pavir.9KG306400.1.p (58)
| | | /--91-+
| | | | | /----- Pavir.5NG119700.1.p (26)
| | | | \---100---+
| | | | \----- Pavir.5NG096100.1.p (44)
| | | |
| | | /-82-+ /---------- Pavir.6KG380000.1.p (13)
| | | | | |
| \-99-+ | | /-92-+ /----- Pavir.J642900.1.p (25)
| | | | | \-83-+
| | | \-100-+ \----- Pavir.6NG327900.1.p (29)
| | | |
| | | \--------------- Pavir.5KG297000.1.p (28)
| | |
| | |-------------------------- Pavir.3NG044100.1.p (27)
| | /-51-+
/--91-+ | | |-------------------------- Pavir.7NG207900.1.p (33)
| | | | |
| | | | |-------------------------- Pavir.4KG106900.1.p (36)
| | | | |
| | | | | /----- Pavir.5KG175400.1.p (39)
| | | | |---------98---------+
| | \-80-+ | \----- Pavir.5KG177900.1.p (43)
| | | |
| | | \-------------------------- Pavir.9KG525300.1.p (57)
| | |
| | | /---------- Pavir.J460500.1.p (11)
| | | |
/-57-+ | \---------100--------+ /----- Pavir.6KG337700.1.p (12)
| | | \-100+
| | | \----- Pavir.6KG335800.1.p (18)
| | |
| | | /---------- Pavir.2KG161700.1.p (8)
| | | |
| | \----------------100----------------+ /----- Pavir.2NG122200.1.p (22)
| | \-100+
| | \----- Pavir.2KG161800.1.p (24)
/-53-+ |
| | | /----- Pavir.4KG054200.1.p (49)
| | \----------------------100---------------------+
| | \----- Pavir.6KG163800.1.p (54)
| |
| | /----- Pavir.5NG313900.1.p (4)
| | /-100+
| | | \----- Pavir.5KG407600.1.p (14)
| \----------------------100---------------------+
| | /----- Pavir.2KG045600.1.p (7)
| \-100+
| \----- Pavir.2NG032000.1.p (50)
|
| /----- Pavir.8NG209600.1.p (23)
--100+ /-100+
| | \----- Pavir.4NG163500.1.p (60)
| /-99-+
| | \---------- Pavir.4KG241600.1.p (41)
| |
| | /----- Pavir.4NG204700.1.p (31)
| /--89-+ |
| | | /-99-+----- Pavir.4NG204500.1.p (56)
| | | | |
| | \-100+ \----- Pavir.4KG209500.1.p (61)
| /-99-+ |
| | | \---------- Pavir.4NG227300.1.p (42)
| | |
| | | /----- Pavir.3KG244300.1.p (40)
\-----------------95----------------+ \------100------+
| \----- Pavir.3NG153600.1.p (51)
|
\-------------------------- Pavir.4KG233600.1.p (47)
Root part of tree:
/------------------------------------------------------------------- Pavir.8KG311400.1.p (1)
|
| /------- Pavir.5NG080200.1.p (20)
|----------------------------100----------------------------+
| \------- Pavir.5KG078600.1.p (30)
|
| /----------------------------------------------- (97)
| |
| | /-------------------- Pavir.5KG723900.1.p (9)
| | |
| | /--91--+ /------------- Pavir.5KG716100.1.p (37)
| | | | |
| | | \--90--+ /------- Pavir.7KG126500.1.p (45)
| | /-100-+ \--95-+
| | | | \------- Pavir.2KG224700.1.p (59)
| /--96--+ | |
+ | | | \--------------------------- Pavir.5KG345600.1.p (34)
| | | /--94--+
| | | | | /------- Pavir.5NG350100.1.p (19)
| | | | | /--73-+
| | | | | | \------- Pavir.5KG231400.1.p (53)
| | | | \--------100--------+
| | | | \------------- Pavir.2NG219900.1.p (21)
| | \--84--+
| /--98-+ | /------- Pavir.J504400.1.p (38)
| | | |---------------100--------------+
| | | | \------- Pavir.5KG722400.1.p (62)
| | | |
| | | | /------- Pavir.5NG294400.1.p (46)
| | | \---------------100--------------+
| | | \------- Pavir.5KG183900.1.p (52)
\--68--+ |
| | /------- Pavir.3KG138300.1.p (15)
| \----------------------100---------------------+
| \------- Pavir.J272800.1.p (48)
|
| /------------- Pavir.9NG223700.1.p (6)
| |
\----------------------100---------------------+ /------- Pavir.1KG322300.1.p (10)
\-100-+
\------- Pavir.1NG284500.1.p (17)
|
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for Bioinformatics, Peking University Last Modified: 2022-12-08 Questions or Comments, please contact  |
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