PlantTFDB
PlantRegMap/PlantTFDB v5.0
Plant Transcription Factor Database
Home  TFext  BLAST  Prediction  Download  Help  About  Links  PlantRegMap
(e.g., LFY)
Transcription Factor Information
Basic Information | Signature Domain | Sequence | 
Basic Information? help Back to Top
TF ID XP_028102475.1
Organism
Camellia sinensis var. sinensis
Taxonomic ID
Taxonomic Lineage
cellular organisms; Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Streptophytina; Embryophyta; Tracheophyta; Euphyllophyta; Spermatophyta; Magnoliophyta; Mesangiospermae; eudicotyledons; Gunneridae; Pentapetalae; asterids; Ericales; Theaceae; Camellia; Camellia sinensis
Family MYB_related
Protein Properties Length: 4706aa    MW: 528948 Da    PI: 5.9785
Description MYB_related family protein
Gene Model
Gene Model ID Type Source Coding Sequence
XP_028102475.1genomeNCBIView CDS
Signature Domain? help Back to Top
Signature Domain
No. Domain Score E-value Start End HMM Start HMM End
1Myb_DNA-binding22.23.2e-0745004531335
                       SS-HHHHHHHHHHHHHTTTT-HHHHHHHHTTTS CS
  Myb_DNA-binding    3 rWTteEdellvdavkqlGggtWktIartmgkgR 35  
                       +WTteE el  ++++q+G++ W+  a  +gk+R
   XP_028102475.1 4500 SWTTEELELVRKYHEQHGPK-WRELADALGKHR 4531
                       7*****************99.********9543 PP
Sequence ? help Back to Top
Protein Sequence    Length: 4706 aa     Download sequence    
MHRHLCEFTG LDVEMEIKEH YSEVMDIVDR LFVAMFDSLN EKCQKELEDI GKQYPFEPLK  60
YLRKTLRLTF QEGVQMLKLS SDYTGIQEKS KLDILLIFPL CISLQILSQS KIPSIKWYQR  120
RPSTKRRDSN FPLAVFNRVT VKKLERGGMY MDISVQEEAT FEGKMGKKTK KNKKNEASAS  180
KEVSDYNGAM LNGVEDGFEL SKEDKRRKKD KKKAEVSSDV ELDGTQNEDI DIKDISVQEE  240
AIFEGKMGKK TKKNKKNEAS ASKEVSDYNG AMLNGMEDGF ELSKEDKRRK KDKKKAEVSS  300
DVELDGTQNE DIDIKDISVQ EEAIFEGKMG KKTKKNKKNE ASASKEVSDY NGAMLNGMED  360
GFELSKEDKR RKKDKKKAEV SSDVELDGTQ NEDIDIKDIS VQEAAIFEGK MGKKTKKNKK  420
NEASASKEVS DYNGAMLNGM EDGFELSKED KRRKKDKKKA EVSSDVELDG TQNEDIDIKD  480
ISVQEAAIFE GKMGKKTKKN KKNEASASKE VSDYNGAMLN GMEDGFELSK EDKRRKKDKK  540
KAEVSSDVEL DGTQNEDIDI KDISVQEAAI FEGKMGKKTK KNKKNEASAS KEVSDYNGAM  600
LNGMEDGFEL SKEDKRRKKD KKKAEVSSDV ELDGTQNEDI DIKDISVQEA AIFEGKMGKK  660
TKKNKKNEAS ASKEVSDYNG AMLNGMEDGF ELSKEDKRRK KDKKKAEVSS DVELDGTQNE  720
DIDIKDISVQ EAAIFEGKMG KKTKKNKKNE ASASKEVSDY NGAMLNGMED GFELSKEDKR  780
RKKDKKKAEV SSDVELDGTQ NEDIDIKDIS VQEAAIFEGK MGKKTKKNKK NEASASKEVS  840
DYNGAMLNGM EDGFELSKED KRRKKDKKKA EVSSDVELDG TQNEDIDIKD ISVQEAAIFE  900
GKMGKKTKKN KKNEASASKE VSDYNGAMLN GMEDGFELSK EDKRRKKDKK KAEVSSDVEL  960
DGTQNEDIDI KDISVQEAAI FEGKMGKKTK KNKKNEASAS KEVSDYNGAM LNGMEDGFEL  1020
SKEDKRRKKD KKKAEVSSDV ELDGTQNEDI DIKDISVQEA AIFEGKMGKK TKKNKKNEAS  1080
ASKEVSDYNG AMLNGMEDGF ELSKEDKRRK KDKKKAEVSS DVELDGTQNE DIDIKDISVQ  1140
EAAIFEGKMG KKTKKNKKNE ASASKEVSDY NGAMLNGMED GFELSKEDKR RKKDKKKAEV  1200
SSDVELDGTQ NEDIDIKDIS VQEAAIFEGK MGKKTKKNKK NEASASKEVS DYNGAMLNGM  1260
EDGFELSKED KRRKKDKKKA EVSSDVELDG TQNEDIDIKD ISVQEAAIFE GKMGKKTKKN  1320
KKNEASASKE VSDYNGAMLN GMEDGFELSK EDKRRKKDKK KAEVSSDVEL DGTQNEDIDI  1380
KDISVQEAAI FEGKMGKKTK KNKKNEASAS KEVSDYNGAM LNGMEDGFEL SKEDKRRKKD  1440
KKKAEVSSDV ELDGTQNEDI DIKDISVQEA AIFEGKMGKK TKKNKKNEAS ASKEVSDYNG  1500
AMLNGMEDGF ELSKEDKRRK KDKKKAEVSS DVELDGTQNE DIDIKDISVQ EAAIFEGKMG  1560
KKTKKNKKNE ASASKEVSDY NGAMLNGMED GFELSKEDKR RKKDKKKAEV SSDVELDGTQ  1620
NEDIDIKDIS VQEAAIFEGK MGKKTKKNKK NEASASKEVS DYNGAMLNGM EDGFELSKED  1680
KRRKKDKKKA EVSSDVELDG TQNEDIDIKD ISVQEAAIFE GKMGKKTKKN KKNEASASKE  1740
VSDYNGAMLN GMEDGFELSK EDKRRKKDKK KAEVSSDVEL DGTQNEDIDI KDISVQEAAI  1800
FEGKMGKKTK KNKKNEASAS KEVSDYNGAM LNGMEDGFEL SKEDKRRKKD KKKAEVSSDV  1860
ELDGTQNEDI DIKDISVQEA AIFEGKMGKK TKKNKKNEAS ASKEVSDYNG AMLNGMEDGF  1920
ELSKEDKRRK KDKKKAEVSS DVELDGTQNE DIDIKDISVQ EAAIFEGKMG KKTKKNKKNE  1980
ASASKEVSDY NGAMLNGMED GFELSKEDKR RKKDKKKAEV SSDVELDGTQ NEDIDIKDIS  2040
VQEAAIFEGK MGKKTKKNKK NEASASKEVS DYNGAMLNGM EDGFELSKED KRRKKDKKKA  2100
EVSSDVELDG TQNEDIDIKD ISVQEAAIFE GKMGKKTKKN KKNEASASKE VSDYNGAMLN  2160
GMEDGFELSK EDKRRKKDKK KAEVSSDVEL DGTQNEDIDI KDISVQEAAI FEGKMGKKTK  2220
KNKKNEASAS KEVSDYNGAM LNGMEDGFEL SKEDKRRKKD KKKAEVSSDV ELDGTQNEDI  2280
DIKDISVQEA AIFEGKMGKK TKKNKKNEAS ASKEVSDYNG AMLNGMEDGF ELSKEDKRRK  2340
KDKKKAEVSS DVELDGTQNE DIDIKDISVQ EAAIFEGKMG KKTKKNKKNE ASASKEVSDY  2400
NGAMLNGMED GFELSKEDKR RKKDKKKAEV SSDVELDGTQ NEDIDIKDIS VQEAAIFEGK  2460
MGKKTKKNKK NEASASKEVS DYNGAMLNGM EDGFELSKED KRRKKDKKKA EVSSDVELDG  2520
TQNEDIDIKD ISVQEAAIFE GKMGKKTKKN KKNEASASKE VSDYNGAMLN GMEDGFELSK  2580
EDKRRKKDKK KAEVSSDVEL DGTQNEDIDI KDISVQEAAI FEGKMGKKTK KNKKNEASAS  2640
KEVSDYNGAM LNGMEDGFEL SKEDKRRKKD KKKAEVSSDV ELDGTQNEDI DIKDISVQEA  2700
AIFEGKMGKK TKKNKKNEAS ASKEVSDYNG AMLNGMEDGF ELSKEDKRRK KDKKKAEVSS  2760
DVELDGTQNE DIDIKDISVQ EAAIFEGKMG KKTKKNKKNE ASASKEVSDY NGAMLNGMED  2820
GFELSKEDKR RKKDKKKAEV SSDVELDGTQ NEDIDIKDIS VQEAAIFEGK MGKKTKKNKK  2880
NEASASKEVS DYNGAMLNGM EDGFELSKED KRRKKDKKKA EVSSDVELDG TQNEDIDIKD  2940
ISVQEAAIFE GKMGKKTKKN KKNEASASKE VSDYNGAMLN GMEDGFELSK EDKRRKKDKK  3000
KAEVSSDVEL DGTQNEDIDI KDISVQEAAI FEGKMGKKTK KNKKNEASAS KEVSDYNGAM  3060
LNGMEDGFEL SKEDKRRKKD KKKAEVSSDV ELDGTQNEDI DIKDISVQEA AIFEGKMGKK  3120
TKKNKKNEAS ASKEVSDYNG AMLNGMEDGF ELSKEDKRRK KDKKKAEVSS DVELDGTQNE  3180
DIDIKDISVQ EAAIFEGKMG KKTKKNKKNE ASASKEVSDY NGAMLNGMED GFELSKEDKR  3240
RKKDKKKAEV SSDVELDGTQ NEDIDIKDIS VQEAAIFEGK MGKKTKKNKK NEASASKEVS  3300
DYNGAMLNGM EDGFELSKED KRRKKDKKKA EVSSDVELDG TQNEDIDIKD ISVQEAAIFE  3360
GKMGKKTKKN KKNEASASKE VSDYNGAMLN GMEDGFELSK EDKRRKKDKK KAEVSSDVEL  3420
DGTQNEDIDI KDISVQEAAI FEGKMGKKTK KNKKNEASAS KEVSDYNGAM LNGMEDGFEL  3480
SKEDKRRKKD KKKAEVSSDV ELDGTQNEDI DIKDISVQEA AIFEGKMGKK TKKNKKNEAS  3540
ASKEVSDYNG AMLNGMEDGF ELSKEDKRRK KDKKKAEVSS DVELDGTQNE DIDIKDISVQ  3600
EAAIFEGKMG KKTKKNKKNE ASASKEVSDY NGAMLNGMED GFELSKEDKR RKKDKKKAEV  3660
SSDVELDGTQ NEDIDIKDIS VQEAAIFEGK MGKKTKKNKK NEASASKEVS DYNGAMLNGM  3720
EDGFELSKED KRRKKDKKKA EVSSDVELDG TQNEDIDIKD ISVQEAAIFE GKMGKKTKKN  3780
KKNEASASKE VSDYNGAMLN GMEDGFELSK EDKRRKKDKK KAEVSSDVEL DGTQNEDIDI  3840
KDISVQEAAI FEGKMGKKTK KNKKNEASAS KEVSDYNGAM LNGMEDGFEL SKEDKRRKKD  3900
KKKAEVSSDV ELDGTQNEDI DIKDISVQEA AIFEGKMGKK TKKNKKNEAS ASKEVSDYNG  3960
AMLNGMEDGF ELSKEDKRRK KDKKKAEVSS DVELDGTQNE DIDIKDIIVT VKKLERCGMY  4020
MEISVQEEAT FEGKMGKKTK KNKKNEASAS KENEDIDIKD ISVQEAAIFE GKMGKKTKKK  4080
QKSEASASKE VSDYNGAMLN GVENGFELSK KDKRRKKDKK KAEVSIDVEL DGTHNEDINL  4140
KDYAEVDDNY QREKEKRKKK KRKLKPGEDN DESNNEIHTG GEERRCLQID DDKDLGNDSE  4200
SKSRKEKKKR HKEDRKKDKK ESVSSPMKVC KDKKTEKDEV VKDQKSSRKD NIADMKNGEE  4260
QIEKKKTHKG RKGKEIIDFD GKKRSTAAED VGKVREYCDV DVSDKVETKK RKREKKKGKD  4320
DLGAGMQEMM AEEFGNKRSL TEDKDFGYNN RNHHSARNKM QEIETKNGDK GNRKKPNSFE  4380
PGSEDPKPKA KSKKVRFSGN IEVFPSSDGP SKGKEKNEDE KLVQGKRFSP EEYEIIKDAV  4440
SNYIRYNDLG EDGLAMVLRC GSHPKIRHCW KDISTVLPHR PLKSVYYRAH ILFERAESRS  4500
WTTEELELVR KYHEQHGPKW RELADALGKH RFHLKDAWCR IKLPNINKGH WSQEEYQNLF  4560
DLVNMDLRIK AYEEKKSKHG MLRDNISWCA ISDKLLTRSY KVGYVKWYHQ LSSSMVAEGN  4620
WADTDDYRLL DTLFSLDACC IEDVDXDYLL DHRSGDLCRK RWNQMINHIG EHKNKSFAEQ  4680
VEILTNRYSP DLLEAREAWD NKPFVD
Nucleic Localization Signal ? help Back to Top
NLS
No. Start End Sequence
1170212KKNKKNEASASKEVSDYNGAMLNGVEDGFELSKEDKRRKKDKK
2206211RRKKDK
3252294KKNKKNEASASKEVSDYNGAMLNGVEDGFELSKEDKRRKKDKK
4288293RRKKDK
5334376KKNKKNEASASKEVSDYNGAMLNGVEDGFELSKEDKRRKKDKK
6370375RRKKDK
7416458KKNKKNEASASKEVSDYNGAMLNGVEDGFELSKEDKRRKKDKK
8452457RRKKDK
9498540KKNKKNEASASKEVSDYNGAMLNGVEDGFELSKEDKRRKKDKK
10534539RRKKDK
11580622KKNKKNEASASKEVSDYNGAMLNGVEDGFELSKEDKRRKKDKK
12616621RRKKDK
13662704KKNKKNEASASKEVSDYNGAMLNGVEDGFELSKEDKRRKKDKK
14698703RRKKDK
15744786KKNKKNEASASKEVSDYNGAMLNGVEDGFELSKEDKRRKKDKK
16780785RRKKDK
17826868KKNKKNEASASKEVSDYNGAMLNGVEDGFELSKEDKRRKKDKK
18862867RRKKDK
19908950KKNKKNEASASKEVSDYNGAMLNGVEDGFELSKEDKRRKKDKK
20944949RRKKDK
219901032KKNKKNEASASKEVSDYNGAMLNGVEDGFELSKEDKRRKKDKK
2210261031RRKKDK
2310721114KKNKKNEASASKEVSDYNGAMLNGVEDGFELSKEDKRRKKDKK
2411081113RRKKDK
2511541196KKNKKNEASASKEVSDYNGAMLNGVEDGFELSKEDKRRKKDKK
2611901195RRKKDK
2712361278KKNKKNEASASKEVSDYNGAMLNGVEDGFELSKEDKRRKKDKK
2812721277RRKKDK
2913181360KKNKKNEASASKEVSDYNGAMLNGVEDGFELSKEDKRRKKDKK
3013541359RRKKDK
3114001442KKNKKNEASASKEVSDYNGAMLNGVEDGFELSKEDKRRKKDKK
3214361441RRKKDK
3314821524KKNKKNEASASKEVSDYNGAMLNGVEDGFELSKEDKRRKKDKK
3415181523RRKKDK
3515641606KKNKKNEASASKEVSDYNGAMLNGVEDGFELSKEDKRRKKDKK
3616001605RRKKDK
3716461688KKNKKNEASASKEVSDYNGAMLNGVEDGFELSKEDKRRKKDKK
3816821687RRKKDK
3917281770KKNKKNEASASKEVSDYNGAMLNGVEDGFELSKEDKRRKKDKK
4017641769RRKKDK
4118101852KKNKKNEASASKEVSDYNGAMLNGVEDGFELSKEDKRRKKDKK
4218461851RRKKDK
4318921934KKNKKNEASASKEVSDYNGAMLNGVEDGFELSKEDKRRKKDKK
4419281933RRKKDK
4519742016KKNKKNEASASKEVSDYNGAMLNGVEDGFELSKEDKRRKKDKK
4620102015RRKKDK
4720562098KKNKKNEASASKEVSDYNGAMLNGVEDGFELSKEDKRRKKDKK
4820922097RRKKDK
4921382180KKNKKNEASASKEVSDYNGAMLNGVEDGFELSKEDKRRKKDKK
5021742179RRKKDK
5122202262KKNKKNEASASKEVSDYNGAMLNGVEDGFELSKEDKRRKKDKK
5222562261RRKKDK
5323022344KKNKKNEASASKEVSDYNGAMLNGVEDGFELSKEDKRRKKDKK
5423382343RRKKDK
5523842426KKNKKNEASASKEVSDYNGAMLNGVEDGFELSKEDKRRKKDKK
5624202425RRKKDK
5724662508KKNKKNEASASKEVSDYNGAMLNGVEDGFELSKEDKRRKKDKK
5825022507RRKKDK
5925482590KKNKKNEASASKEVSDYNGAMLNGVEDGFELSKEDKRRKKDKK
6025842589RRKKDK
6126302672KKNKKNEASASKEVSDYNGAMLNGVEDGFELSKEDKRRKKDKK
6226662671RRKKDK
6327122754KKNKKNEASASKEVSDYNGAMLNGVEDGFELSKEDKRRKKDKK
6427482753RRKKDK
6527942836KKNKKNEASASKEVSDYNGAMLNGVEDGFELSKEDKRRKKDKK
6628302835RRKKDK
6728762918KKNKKNEASASKEVSDYNGAMLNGVEDGFELSKEDKRRKKDKK
6829122917RRKKDK
6929583000KKNKKNEASASKEVSDYNGAMLNGVEDGFELSKEDKRRKKDKK
7029942999RRKKDK
7130403082KKNKKNEASASKEVSDYNGAMLNGVEDGFELSKEDKRRKKDKK
7230763081RRKKDK
7331223164KKNKKNEASASKEVSDYNGAMLNGVEDGFELSKEDKRRKKDKK
7431583163RRKKDK
7532043246KKNKKNEASASKEVSDYNGAMLNGVEDGFELSKEDKRRKKDKK
7632403245RRKKDK
7732863328KKNKKNEASASKEVSDYNGAMLNGVEDGFELSKEDKRRKKDKK
7833223327RRKKDK
7933683410KKNKKNEASASKEVSDYNGAMLNGVEDGFELSKEDKRRKKDKK
8034043409RRKKDK
8134503492KKNKKNEASASKEVSDYNGAMLNGVEDGFELSKEDKRRKKDKK
8234863491RRKKDK
8335323574KKNKKNEASASKEVSDYNGAMLNGVEDGFELSKEDKRRKKDKK
8435683573RRKKDK
8536143656KKNKKNEASASKEVSDYNGAMLNGVEDGFELSKEDKRRKKDKK
8636503655RRKKDK
8736963738KKNKKNEASASKEVSDYNGAMLNGVEDGFELSKEDKRRKKDKK
8837323737RRKKDK
8937783820KKNKKNEASASKEVSDYNGAMLNGVEDGFELSKEDKRRKKDKK
9038143819RRKKDK
9138603902KKNKKNEASASKEVSDYNGAMLNGVEDGFELSKEDKRRKKDKK
9238963901RRKKDK
9339423984KKNKKNEASASKEVSDYNGAMLNGVEDGFELSKEDKRRKKDKK
9439783983RRKKDK
9540374079KKNKKNEASASKEVSDYNGAMLNGVEDGFELSKEDKRRKKDKK
9640404082KKNKKNEASASKEVSDYNGAMLNGVEDGFELSKEDKRRKKDKK
9740754117KKNKKNEASASKEVSDYNGAMLNGVEDGFELSKEDKRRKKDKK
9841144119RRKKDK
9941524161REKEKRKKKK
10041554164EKRKKKKRKL
10141564162KRKKKKR
10241564164KRKKKKRKL
10341574163KRKKKKR
10441574165KRKKKKRKL
10541574162RKKKKR
10641574166RKKKKRKLKP
10741584163KKKKRK
10841584167RKKKKRKLKP
10941594164KKKRKL
11041594168RKKKKRKLKP
11142024217KSRKEKKKRHKEDRKK
11242054217KEKKKRHKEDRKK
11342074233KKKRHKEDRKKDKKESVSSPMKVCKDK
11442644268KKKTH
11543094316KKRKREKK
11643124320KREKKKGKD
Best hit in Arabidopsis thaliana ? help Back to Top
Hit ID E-value Description
AT5G41020.11e-118MYB_related family protein